Корни растений помещаются в закрытую емкость или систему, где у них есть свободный доступ к воздуху, а разбрызгиватели регулярно обеспечивают питанием – каждые несколько минут. Таймер управляет насосом подачи питательного раствора так же, как и при других типах гидропонных систем. Отличием аэропоники является частота включения насоса: нужен таймер короткого цикла, который запускает насос в течение нескольких секунд каждые несколько минут.

Иногда применяют аэропонику, опрыскивание в котором работает постоянно без таймера. Главное преимущество аэропоники – это возможность выращивать цветы и зелень в гидропонных башнях (ссылка на этот раздел), используя вертикальное пространство теплицы. Некоторые специалисты утверждают, что уже не за горами то будущее, когда прямо в городах будут располагаться крупные многоуровневые тепличные комплексы, работающие по системе аэропоники.